更新日：2024年4月1日
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| 市長─ | ┬ | 副市長 | ┬ | ─ | 企画財政部 | ┬ | 市長公室 | （伊豆長岡庁舎2階） |
| │ | │ | ├ | 企画課 | （伊豆長岡庁舎2階） | ||||
| ｜ | ｜ | ├ | 協働まちづくり課 | （伊豆長岡庁舎2階） | ||||
| │ | │ | └ | 財務課 | （伊豆長岡庁舎2階） | ||||
| │ | │ | |||||||
| │ | ├ | ― | 総務部 | ┬ | 総務課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||
| ｜ | ｜ | ├ | 管財営繕課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||||
| │ | │ | ├ | 行政経営課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||||
| │ | │ | ├ | 情報政策課 | （大仁庁舎別館） | ||||
| │ | │ | └ | 危機管理課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||||
| │ | │ | |||||||
| │ | ├ | ┬ | 市民環境部 | ┬ | 市民課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||
| │ | │ | ├ | 韮山支所 | ― | 市民課 | （韮山農村環境改善センター） | ||
| │ | │ | └ | 大仁支所 | ― | 市民課 | （大仁庁舎1階） | ||
| ｜ | ｜ | ├ | 税務課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||||
| ｜ | ｜ | ├ | 国保年金課 | （伊豆長岡庁舎1階） | ||||
| │ | │ | ├ | 環境政策課 | （大仁庁舎1階） | ||||
| │ | │ | └ | 廃棄物対策課 | （大仁庁舎1階） | ||||
| ｜ | ｜ | |||||||
| │ | │ | ┬ | 健康福祉部 | ― | 健康づくり課 | （韮山福祉・保健センター） | ||
| │ | │ | └ | 福祉事務所 | ┬ | （大仁庁舎1階） | |||
| │ | │ | ├ | 障がい福祉課 | （大仁庁舎1階） | ||||
| │ | │ | ├ | 長寿介護課 | （大仁庁舎1階） | ||||
| ｜ | ｜ | └ | こども家庭センター | （大仁庁舎1階） | ||||
| │ | │ | |||||||
| │ | │ | ― | 産業部 | ┬ | 観光文化課 | （あやめ会館1階） | ||
| │ | │ | ├ | 商工課 | （あやめ会館1階） | ||||
| │ | │ | └ | 農林課 | （あやめ会館1階） | ||||
| │ | │ | |||||||
| │ | └ | ― | 都市整備部 | ┬ | 都市計画課 | （伊豆長岡庁舎別館2階） | ||
| │ | ├ | 建設課 | （伊豆長岡庁舎別館2階） | |||||
| │ | ├ | 水道課 | （伊豆長岡庁舎別館1階） | |||||
| │ | └ | 下水道課 | （伊豆長岡庁舎別館1階） | |||||
| │ | ||||||||
| └ | ――― | ― | ― | 会計管理者 | ― | 会計課 | （伊豆長岡庁舎1階） | |
| 教育委員会―教育長― | 教育部 | ┬ | 学校教育課 | （あやめ会館2階） | ||||
| │ | ├（小中学校） | |||||||
| │ | └（給食センター） | |||||||
| ├ | 教育施設整備課 | （あやめ会館2階） | ||||||
| ├ | 幼児教育課 | （あやめ会館2階） | ||||||
| │ | └（保育園） | |||||||
| │ | └（幼稚園） | |||||||
| │ | └（こども園） | |||||||
| ├ | 生涯学習課 | （あやめ会館1階） | ||||||
| │ | └（図書館） | |||||||
| └ | 文化財課 | （あやめ会館2階） | ||||||
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